Impacts environnementaux: le milieu marin est bénéfique à l’élevage du saumon, mais ce dernier est néfaste à l’écosystème marin

Les élevages de saumons sont stratégiquement situés dans des endroits le long de la côte pour mieux profiter des courants marins qui sont riches en oxygène essentiel à l'espèce. Ces courants dispersent aussi gratuitement tous les déchets produits par les fermes d'élevage. Toutefois, il y a des coûts environnementaux associés à cette pratique; les déchets produits (sécrétions et déchets alimentaires) par ces fermes se déposent sur le fond marin et changent sa composition chimique et sa diversité biologique. D’autres espèces de poissons sont aussi affectées par cette pratique; par exemple, la sébaste, un poisson de la côte Ouest, voit son niveau de mercure augmenté quand il vit près des enclos.

Les Premières Nations rapportent que leurs zones de récolte traditionelle de palourdes près des fermes salmonicoles sont couvertes de boue puante qui noircie les palourdes et les rend non comestibles. Finalement, certains pêcheurs remarquent que la pêche de certaines espèces est moins fructueuse à proximité des fermes salmonicoles.